小和尚一休生活在日本幕府时代,他勤奋好学,热心助人。一休由于天资聪颖、爱动脑筋,经常能将人们日常生活无法解决的问题聪明化解,于是英名远播。由于一休名声在外,经常就有一些需要帮助或者故意想刁难他的人会找上门来。热心的一休总是来者不拒,只要有问题相求,他总是会开动他聪明的脑筋解决问题。因此,无论是将军,桔梗店老板还是新右卫门先生总是难不到聪明的一休。一休解决问题,不仅让坏人们得到了应有的惩治,而且还会教会你很多生活中的窍门。
铃木园子的叔叔次郎吉不甘心失败,决定再次向怪盗基德发出挑战。这位坏脾气的大叔斥巨资制造了巨型的飞船贝尔·雪利二世号,并以镶嵌有名贵宝石“天空的贵妇人”的戒指作赌注,邀请基德前来挑战,看他能否在东京到大阪的这6小时时间内完成这项困难的任务。柯南、小兰等人理所当然也接到邀请,甚至电视台的人也兴师动众前来。随着时间的流逝,双方的对决悄悄展开。另一方面,恐怖组织红色暹罗猫也登上了飞船。此前不久,红色暹罗猫袭击了国立东京微生物研究所,并盗走一种致命的病毒。本片根据青山刚昌的同名漫画改编,是该动画的第14部剧场版。