故事发生在遥远的未来,彼时,大陆板块的活动令海水渐渐淹没了日本的大部分国土,人们不得不在海上建造起新的都市。随着时间的推移,海上都市的规模越来越大,航路越来越复杂,为了维持秩序,一种人们称之为“蓝色人鱼”的新型职业渐渐被大众所接收和憧憬,这份光荣的职业亦成为了很多女子高中生们未来奋斗的目标。 活泼开朗乐观向上的岬明乃(夏川椎菜 配音)、沉默寡言外冷内热的宗谷真白(Lynn 配音)、害羞内向但在熟人面前有着十分可爱的一面的立石志摩(古木望 配音)、傲娇毒舌非常在意自己身高的西崎芽依(种崎敦美 配音),这些个性迥异的女孩子们,是否能够实现她们心中的理想呢?
「生于大海,守护大海,去往大海——那就是“蓝色人鱼”!」距今约100年前,由于板块运动,日本的大部分国土被水淹没而消失。为了保全国土而接连建成的水上都市不知何时成为了海上都市,随着连结它们的航路增大,需要更多的人员来保护海洋安全。由此,工作的女性进出海上、守护海洋安全的职业“蓝色人鱼”成为了女学生们憧憬的存在。在这样的时代,幼时好友的岬明乃和知名萌香,和拥有“成为蓝色人鱼”这一目标的伙伴们一起,进入了横须贺的海洋高中学习。